Science vol322 page 275

Environmental Genomics Reveals a Single-Species
Ecosystem Deep Within Earth

這篇論文很值得一看,看現在微生物研究的程度

簡單來說這篇論文有幾個重點

1. 可以從環境中擷取零散的DNA片段,並且將它組合成一個完整
的genome,這個超越了以前只有部分序列的作法
以此類推 korarchaeota 是有能耐作 total sequence的?

2. 現在可以完全用 sequence 推出所有的生化代謝途徑
只要沒有超出理解範圍, even 這株菌不好或無法培養

3. 這株菌 Candidatus Desulforudis audxviator
一個人活在地底 2.8 km 的深處
自己可以進行 Nitrogen Fixation, Carbon Fixation
Oxidation and dissolution of pyrite,
radioactive of bicarbonatem Sulfate reduction
以及其他功能,完整包含了物質流轉即能量供給
所以被接受它自己建構了一個生態系
一個人的 ecosystem

本來 meeting 想要報這篇
結果那天老師請假
算了,這樣我就只要看我自己想看的部分就好 :)


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